다만, 해경은 특수활동비를 둘러싼 상황이 복잡해졌다. 해경이 국민안전처에서 독립하고 경찰청으로 넘어간 수사권을 다시 돌려 받을 경우 특수활동비는 현행보다 늘어나야 하기 때문이다. 결국 특수활동비가 늘어날 경우 논란이 벌어질 가능성도 상존한다.
국민안전처 관계자는 "국민안전처가 지난 2014년 설립되고 해경이 산하로 들어왔지만, 해경의 밀수 등 육상 수사 기능이 경찰청으로 넘어가면서 특수활동비는 이전에 비해 크게 축소된 규모"라며 "중국 어선 단속 업무, 해양사고 사망 처리 등 일부 부문에 한해 남아 있다"고 말했다.
그러나 새 정부에서 해경이 해경청으로 분리 독립할 경우 계산은 복잡해진다. 해경이 독립하게 되면 경찰청에 넘겨준 육상 수사 기능을 다시 돌려받아야 한다. 이 경우 지금보다 특수활동비가 늘어날 여지는 크다.
결국 해경이 특수활동비를 이전보다는 절약해 축소한다 하더라도, 수사권 이양에 따른 절대 규모는 늘어날 수밖에 없다. 해경으로서는 뜻하지 않은 '특수활동비' 논란에 휘말릴 가능성도 있다.
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반면 권익위는 특수활동비 축소는 별다른 영향이 없을 것이라고 말했다. 권익위 관계자는 "특수활동비의 규모가 작아 별다른 대책을 세우지 않고 있다"며 "감축하더라도 영향이 거의 없을 것"이라고 제시했다.