다수의 장관 후보자들이 재산 형성 과정의 의혹을 받고 있고 일부 후보자를 대상으로 도덕성 및 자질 시비가 일고 있어 한나라당과 통합민주당 사이에 '난투극'이 예상된다.
민주당측이 가장 강하게 반발하고 있는 청문 대상자는 남주홍 통일, 박은경 환경장관 후보자다.
박은경 후보자는 1999년 매입한 경기 김포시의 절대농지를 보유한 사실이 드러나 부동산 투기 의혹을 받고 있다. 의혹이 일자 "자연의 일부인 땅을 사랑할 뿐"이라고 해명한 것이 반발을 키웠고 민주당은 사퇴를 요구하고 있다. 이외에도 남편과 공동 명의로 돼 있는 평창동 자택과 관련, 세금 체납 의혹이 불거졌다.
김성이 보건복지가족부 장관 후보자는 5공 시절 '정화사업' 유공으로 대통령표창을 받은 것이 문제가 되고 있다. 아울러 논문 5개를 학술지 12곳에 중복 게재한 의혹과 지난 2001년 청소년보호위원장으로 재직하면서 공금 1280만원을 유용한 의혹도 받고 있고 부동산 투기, 소득 축소신고 의혹이 일었다.
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장관 후보자들 중 가장 많은 재산(140억)을 신고했던 유인촌 문화체육관광부 장관 후보자도 '뭇매'를 맞고 있다. 민주당은 유 후보자의 재산 부실신고 혹은 허위신고 의혹, 자녀 고액과외 및 재산 증여 의혹을 잇따라 제기하고 나섰다.
이밖에 강만수 기획재정, 정종환 국토해양부 장관 후보자가 부동산 투기 및 병역면제 의혹을 받고 있고 이윤호 지식경제부 장관 후보자는 자녀 국적 상실 논란에 처해 있다.
원세훈 행정안전, 김경환 법무부 장관 후보자의 경우 병역 면제 경위에 대한 논란이 예상된다.